中央分析室は、化合物の構造に関する情報を得ることができる核磁気共鳴（NMR）装置と、質量に関する情報を得ることができる質量分析（MS）装置の、2つの装置の運営・管理全般を受け持っています。また、通常の構造解析だけでなく、LC-NMRや固体NMRを用いた新しい利用方法の開発研究や生体中の微量成分の分析研究などを行っています。